Agrément Crédit d’Impôt Recherche (CIR) – Crédit d’Impôt Innovation (CII)

Sous-traitance : qu'est-ce que l’agrément CIR-CII ?

Un donneur d’ordre qui externalise certaines opérations de R&D ou d’Innovation peut inclure les dépenses correspondantes dans sa propre déclaration CIR ou CII si son sous-traitant dispose de l’agrément CIR.

Ainsi, une entreprise agréée au titre du CIR, ou CII le cas échéant, peut rendre éligibles au Crédit d’Impôt Recherche, ou Crédit d’Impôt Innovation, les montants qu’elle facture à un donneur d’ordre au titre des opérations de R&D ou d’innovation externalisées. L’obtention de l’agrément CIR-CII se fait sur demande par l’entreprise, au moyen de la présentation d’un exemple de projet de R&D réalisé dans les 12 derniers mois.

Si vous souhaitez en savoir plus sur le CIR et la sous-traitance, nous vous invitons à consulter notre article et guide dédiés à ce sujet.

L’agrément au titre de la recherche permet également au donneur d’ordre de s’assurer que le prestataire a mené sous sa responsabilité scientifique et avec ses propres moyens des opérations de recherche scientifique et technique.

Comment savoir si une entreprise est agréée ?

La liste des structures agréées est disponible sur le site du ministère de l’enseignement supérieur, de la recherche et de l’innovation (MESRI) sauf demande contraire de leur part.

Liste des organismes, experts, bureaux de style et stylistes agréés CIR et CII 

Comment obtenir l'agrément CIR-CII délivré par le MESRI ?

Afin d’obtenir l’agrément CIR, il est nécessaire de faire une demande d’agrément CIR-CII en ligne.

Depuis 2025, l’État a entièrement modernisé la procédure via la plateforme CIROCO, devenue le seul canal officiel pour déposer une demande d’agrément, la renouveler et dialoguer avec l’administration.

La plateforme CIROCO

Le dépôt d’un agrément CIR s’effectue exclusivement via CIROCO, la plateforme officielle du Ministère de l’Enseignement supérieur et de la Recherche, qui centralise désormais toutes les procédures relatives au Crédit d’Impôt Recherche. Depuis la dématérialisation complète du dispositif, CIROCO est devenu le point d’entrée unique pour déposer un dossier, transmettre les justificatifs et suivre l’ensemble des échanges avec l’administration. Le processus se déroule intégralement en ligne et nécessite une navigation séquentielle, de la création de l’espace utilisateur jusqu’à la validation du dossier complet.

La première étape consiste à se connecter au portail CIROCO et à accéder à l’espace dédié aux demandes d’agrément. La plateforme permet à chaque organisme privé — qu’il s’agisse d’une entreprise, d’une association ou d’un organisme de recherche établi en France ou dans l’Union européenne — de lancer une procédure d’agrément en vue de prouver sa capacité à réaliser des travaux de recherche pour le compte de tiers. Une fois connecté, l’utilisateur choisit le type d’agrément souhaité : agrément CIR pour la R&D, agrément CIR accompagné d’un agrément CII, ou encore agrément CICo, destiné aux organismes reconnus comme institutions de recherche et de diffusion de la connaissance. CIROCO prend en charge l’intégralité de ces scénarios, y compris les demandes conjointes permettant d’obtenir simultanément les agréments CIR et CII lorsque les conditions sont réunies, sans obligation de constituer un second dossier spécifique pour l’innovation.

Le dépôt de la demande implique ensuite la constitution d’un dossier administratif et scientifique complet. Sur la partie administrative, CIROCO sollicite les informations légales de l’organisme ainsi que les pièces justificatives attestant de son existence, de son organisation et des compétences de son personnel. Les documents doivent être fournis exclusivement en français ou en anglais, un point contrôlé strictement par le ministère lors de l’instruction du dossier.

La partie scientifique constitue le cœur de l’agrément CIR. L’organisme doit présenter une opération de R&D récente, réalisée avec ses propres moyens et conforme aux critères définis dans le référentiel du CIR. La plateforme CIROCO exige une description structurée mettant en avant l’existence d’un verrou scientifique ou technologique, la démarche suivie pour lever ce verrou, la méthodologie expérimentale mise en œuvre et les résultats obtenus. Cette opération est ensuite analysée par un expert scientifique mandaté par le MESR, dont l’évaluation repose entièrement sur la qualité, la cohérence et la technicité du projet présenté. Au moment du dépôt, le demandeur doit également sélectionner le domaine scientifique correspondant à son opération, en utilisant la nomenclature officielle du ministère organisée par sous‑section afin de classifier précisément la nature de ses travaux de recherche.

Une fois l’ensemble des éléments réunis et téléversés dans CIROCO, la demande est formellement enregistrée et soumise aux services instructeurs. Le processus ne débute réellement qu’à partir du moment où le dossier est considéré comme complet. C’est seulement à partir de cette date que court le délai moyen d’instruction, fixé à environ huit mois, et durant lequel aucune relance n’est nécessaire ni prise en compte par l’administration, conformément aux indications officielles du MESR.

À l’issue de la soumission, CIROCO devient l’interface de suivi de l’organisme. La plateforme permet progressivement de consulter l’avancement du traitement, de répondre aux éventuelles demandes complémentaires du ministère et, à terme, de gérer d’autres démarches comme le dépôt d’un rescrit CIR ou le suivi des expertises scientifiques réalisées dans le cadre d’un contrôle fiscal. Toutes ces fonctionnalités sont intégrées dans l’écosystème CIROCO, qui vise à simplifier et sécuriser la relation entre les organismes innovants et l’administration en charge du crédit d’impôt recherche.

 

Le calendrier de dépôt des demandes d'agrément CIR et CIR/CII

Les procédures sont différentes selon que l’agrément porte sur le CIR ou le CII.

Procédure pour l'agrément CIR

Pour une première demande, le dossier doit être déposé auprès du ministère en charge de la recherche entre le 1er janvier et le 31 mars de l’année demandée. A défaut, l’agrément est accordé à partir de l’année suivante.

Pour un renouvellement d’agrément CIR, le dossier doit être envoyé entre le 15 août et le 30 novembre de la dernière année accordée.

Pour une demande d’agrément CIR et CII en même temps, la procédure CIR s’applique. 

Procédure pour l'agrément CII

Pour une première demande, le dossier doit être envoyé à la DGE avant le 30 septembre de l’année demandée.

Pour un renouvellement, le calendrier est similaire au CIR: le dossier doit être envoyé entre le 15/08 et le 30/11 de la dernière année accordée.

En cas de demande d’agrément CII par un organisme déjà agréé au titre du CIR, le dossier est identique à la première demande d’agrément, seulement le mode d’envoi diffère. En effet, la demande est à envoyer directement par mail à l’adresse suivante : ciragrement@recherche.gouv.fr

Le délai moyen de traitement d’un dossier de demande d’agrément est de 8 mois. Ce délai commence à partir du moment où le dossier est complet.

De quoi doit être composé le dossier d’agrément CIR-CII ?

Le dossier de demande d’agrément CIR-CII est un dossier administratif très semblable à un dossier de justification du CIR dans lequel on devra retrouver certains documents administratifs tels que :

  • La présentation de l’organisme : Lieu de résidence, le numéro de TVA, la raison sociale, la forme juridique, le code NAF ou APE, la date de création, le site internet…
  • Les données économiques et ressources humaines : Chiffres d’affaires du dernier exercice, le montant de la R&D facturé au cours du dernier exercice, le nombre de chercheurs, d’ingénieurs en équivalent temps plein, le nombre de techniciens en équivalent temps plein, l’activité de recherche et développement principale de l’organisme…
  • Les opérations de recherche ou innovation : le détail de l’opération de recherche ou d’innovation (cf, le dossier justificatif CIR)
  • Les expériences et diplômes des participants à l’opération de recherche ou d’innovation
  • Les coordonnées de contact

Les formulaires et les documents à fournir varient en fonction de la nature de l’entité qui fait la demande d’agrément.

L'agrément CIR/CII selon les sources officielles

Pour en savoir plus

Crédit Impôt Recherche (CIR)

CIR et sous-traitance

Crédit Impôt Innovation (CII)

CIR, CII, JEI, IP Box et subventions

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